Seit dem Beginn der ACG 1986 war ihr Hauptzweck, ein einziger Block mit einer Ausdehnung von 163.000 ha zu sein, der heutzutage von 100 m unter dem Meeresspiegels in der Umgebung des Murciélago-Archipels über die Flächen Santa Rosas bis zu den Gipfeln der Vulkane Orosí, Cacao und Rincón de la Vieja (1916 m ü. NN) reicht und setzt sich bis in die nördliche Region des Landes fort. Um die Administration und Operation der ACG zu erleichtern, wurde die ACG strategisch unter geografischen und biologischen Kriterien in die folgenden Sektoren unterteilt: Santa Rosa, Pocosol, Santa Elena, Murciélago, El Hacha, Orosi, Cacao, Pitilla, San Cristóbal, Pailas, Santa Maria, Mundo Nuevo, Rincon Rain Forest und Horizontes.
Karte der Sektoren, Área de Conservación Guanacaste
Innerhalb des organisatorischen und philosophischen Rahmens der ACG, die mit einer einzigartigen administrativen und operativen Direktion arbeitet, die Personal in verschiedenen Programmen an verschiedenen Orten besitzt, befindet sich das Programm der Sektoren, verantwortlich für die Koordinierung der permanenten Präsenz von Personal in allen Stationen innerhalb der Sektoren der ACG, aber auch das Wachen über die Instandhaltung der Infrastruktur und Installationen dieser Stationen sowie ihrer Logistik, außerdem das Entwickeln einer Koordination von Aktivitäten der Forschung, Tourismus oder anderer Art, die in den Sektoren entwickelt wird.
Zur Koordinierung besitzt das Programm der Sektoren drei Personen. Das Personal in den Stationen besteht zum Großteil aus lokalen Leuten. Gesamt sind es 25 Angestellte, die mit den Forschern, Insektensammlern und Touristen zusammenarbeiten und sie unterstützen, außerdem bewachen und beschützen sie ihren Sektor, aber kümmern sich auch um das Erheben wichtiger Daten, wie solche meteorologischer Natur, biologischer Beobachtungen und Sammeln von GPS-Daten.